GENESIS(ジェネシス)とは？評判･口コミや料金について

GENESISとは？

GENESISとは、理化学研究所　計算科学研究センターで開発されたソフトウェアのことです。
独自の計算アルゴリズムを使って並列計算の効率化や高度なシミュレーションが可能です。
さまざまな研究機関や大学の京や富岳などのスーパーコンピュータにインストールされています。
オープンソースソフトウェアとして公開されており、今後もさらなる発展・成長を続けていくことでしょう。
これまで行われた応用事例では、主に以下のものがあります。

・生体分子運動解析の研究
・バクテリアの細胞内にある分子の動きをシミュレーションする研究　など

主にインストールされているコンピュータ

・理化学研究所　計算科学研究センター「スーパーコンピュータ「富岳」」
・北海道大学　情報基盤センター「スーパーコンピュータ(Grand Chariot )」
・名古屋大学　情報基盤センター「スーパーコンピュータ(不老)」
・九州大学　情報基盤研究センター「ITOサブシステムA・B」　など

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GENESISの特徴

分子動力学計算を行う

GENESISは、分子動力学計算を行うソフトウェアです。
分子動力学計算とは、タンパク質、糖質、脂質、核酸などの複合体などの生体内にある高分子を研究するために用いられる計算です。
生体内にある高分子を研究することは、生命の仕組みや構造を理解していくためにとても重要な研究になります。
そのため、GENESISはその研究のための大切なソフトウェアの1つです。

高速な計算ができる

GENESISは、スーパーコンピュータなどの膨大な数のCPUを持っているコンピュータを効果的に運用するための機能があります。
主に、並列化・高速化させて計算を効率的に行うためのアルゴリズムが搭載されており、さまざまな計算を高速で処理可能です。
そのため、これまで実現させることができなかった生体分子系の計算も可能になりました。

高度なシミュレーションができる

GENESISは、レプリカを用いたシミュレーションができます。
計算の対象であるシステムのコピーを作成し、構造のサンプリングや計算のシミュレーションを行うことが可能です。
また、現在でも常に新しい計算手法を開発し続けており、その計算手法をGENESISに導入しているため、今後さらなる成長を遂げていくでしょう。
そのため、計算能力や分析能力は現在も向上し続けています。

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